Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPD1

Fbxo11, F-box only protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo11Q7TPD1 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fbxo11Q7TPD1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fbxo11Q7TPD1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms