Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ubfd1Q78JW9 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ubfd1Q78JW9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ubfd1Q78JW9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Ubfd1Q78JW9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Ubfd1Q78JW9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ubfd1Q78JW9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms