Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rph3alQ768S4 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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