Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SynmQ70IV5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SynmQ70IV5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SynmQ70IV5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SynmQ70IV5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SynmQ70IV5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SynmQ70IV5 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SynmQ70IV5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SynmQ70IV5 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SynmQ70IV5 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SynmQ70IV5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SynmQ70IV5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SynmQ70IV5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SynmQ70IV5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SynmQ70IV5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SynmQ70IV5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SynmQ70IV5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms