Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR4

Ppp2r2b, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp2r2bQ6ZWR4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ppp2r2bQ6ZWR4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ppp2r2bQ6ZWR4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms