Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NinlQ6ZQ12 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NinlQ6ZQ12 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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