Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Znf653Q6YND2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Znf653Q6YND2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms