Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc88cQ6VGS5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms