Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Timd4Q6U7R4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms