Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Trim45Q6PFY8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim45Q6PFY8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms