Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rad54bQ6PFE3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms