Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Trak1Q6PD31 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trak1Q6PD31 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trak1Q6PD31 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms