Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Usp49Q6P9L4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms