Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8N9

Cyp2d40, Cytochrome P450, family 2, subfamily d, polypeptide 40, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cyp2d40Q6P8N9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp2d40Q6P8N9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms