Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC061212Q6P8K3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC061212Q6P8K3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC061212Q6P8K3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC061212Q6P8K3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC061212Q6P8K3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC061212Q6P8K3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC061212Q6P8K3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC061212Q6P8K3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC061212Q6P8K3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BC061212Q6P8K3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC061212Q6P8K3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC061212Q6P8K3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC061212Q6P8K3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC061212Q6P8K3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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