Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T2

Snrnp200, U5 small nuclear ribonucleoprotein 200 kDa helicase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp200Q6P4T2 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Snrnp200Q6P4T2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snrnp200Q6P4T2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.6 ms