Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZL0

Soga3, Protein SOGA3, mousemouse

Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga3Q6NZL0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Soga3Q6NZL0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Soga3Q6NZL0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms