Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gpbp1Q6NXH3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms