Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HelbQ6NVF4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
HelbQ6NVF4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms