Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg16l2Q6KAU8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms