Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cep78Q6IRU7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cep78Q6IRU7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms