Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQT6

Scap, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScapQ6GQT6 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ScapQ6GQT6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms