Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Atg9bQ6EBV9 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Atg9bQ6EBV9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms