Protein–RNA interactions for Protein: Q6A0D4

Rftn1, Raftlin, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn1Q6A0D4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rftn1Q6A0D4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rftn1Q6A0D4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms