Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Jmjd1cQ69ZK6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Jmjd1cQ69ZK6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Jmjd1cQ69ZK6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Jmjd1cQ69ZK6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Jmjd1cQ69ZK6 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Jmjd1cQ69ZK6 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Jmjd1cQ69ZK6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Jmjd1cQ69ZK6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Jmjd1cQ69ZK6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Jmjd1cQ69ZK6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Jmjd1cQ69ZK6 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Jmjd1cQ69ZK6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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Jmjd1cQ69ZK6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Jmjd1cQ69ZK6 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Jmjd1cQ69ZK6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Jmjd1cQ69ZK6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Jmjd1cQ69ZK6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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