Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cntn4Q69Z26 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cntn4Q69Z26 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms