Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Pkp4Q68FH0 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Pkp4Q68FH0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pkp4Q68FH0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pkp4Q68FH0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pkp4Q68FH0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pkp4Q68FH0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pkp4Q68FH0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Pkp4Q68FH0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkp4Q68FH0 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms