Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Znf280dQ68FE8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Znf280dQ68FE8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms