Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Top2bQ64511 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Top2bQ64511 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms