Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc18Q640L5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc18Q640L5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc18Q640L5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms