Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CochQ62507 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CochQ62507 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CochQ62507 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CochQ62507 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CochQ62507 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CochQ62507 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CochQ62507 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CochQ62507 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CochQ62507 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CochQ62507 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CochQ62507 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CochQ62507 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CochQ62507 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CochQ62507 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CochQ62507 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CochQ62507 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CochQ62507 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CochQ62507 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CochQ62507 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CochQ62507 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CochQ62507 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CochQ62507 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CochQ62507 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CochQ62507 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CochQ62507 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CochQ62507 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CochQ62507 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CochQ62507 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CochQ62507 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CochQ62507 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CochQ62507 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CochQ62507 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CochQ62507 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CochQ62507 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CochQ62507 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms