Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm20854Q62461 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Gm20854Q62461 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm20854Q62461 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm20854Q62461 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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Gm20854Q62461 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Gm20854Q62461 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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