Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtmQ62388 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtmQ62388 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AtmQ62388 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
AtmQ62388 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtmQ62388 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtmQ62388 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
AtmQ62388 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms