Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ss18Q62280 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Ss18Q62280 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ss18Q62280 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
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