Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.44
Kdm5dQ62240 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Kdm5dQ62240 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms