Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sycp1Q62209 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sycp1Q62209 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms