Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Ttf1Q62187 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ttf1Q62187 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ttf1Q62187 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ttf1Q62187 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ttf1Q62187 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Ttf1Q62187 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ttf1Q62187 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ttf1Q62187 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Ttf1Q62187 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ttf1Q62187 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ttf1Q62187 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms