Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sema4aQ62178 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sema4aQ62178 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms