Protein–RNA interactions for Protein: Q62100

Prm3, Protamine-3, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm3Q62100 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prm3Q62100 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prm3Q62100 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prm3Q62100 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prm3Q62100 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prm3Q62100 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prm3Q62100 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prm3Q62100 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Prm3Q62100 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prm3Q62100 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Prm3Q62100 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Mrps36-ps2-201ENSMUST00000118658 309 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm14746-201ENSMUST00000120309 741 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm13674-201ENSMUST00000121276 823 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Mir669a-7-201ENSMUST00000180364 87 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Mir669a-6-201ENSMUST00000196127 87 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Mir669a-12-201ENSMUST00000197274 87 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Mir669a-5-201ENSMUST00000197439 87 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Mir669a-10-201ENSMUST00000197745 87 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Mir669a-11-201ENSMUST00000197952 87 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Mir669a-4-201ENSMUST00000198665 87 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Mir669a-9-201ENSMUST00000200087 87 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Mir669a-8-201ENSMUST00000200268 87 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 AC147628.1-201ENSMUST00000228193 688 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm17046-201ENSMUST00000168078 850 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 1700025F22Rik-203ENSMUST00000181284 562 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm30655-201ENSMUST00000220498 1383 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm26595-201ENSMUST00000181585 484 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 AC153528.1-201ENSMUST00000217696 434 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm40646-202ENSMUST00000218796 793 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Gm29794-201ENSMUST00000218919 1247 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prm3Q62100 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms