Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Phox2aQ62066 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
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