Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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AtrxQ61687 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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AtrxQ61687 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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AtrxQ61687 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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AtrxQ61687 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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AtrxQ61687 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
AtrxQ61687 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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