Protein–RNA interactions for Protein: Q61495

Dsg1a, Desmoglein-1-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1aQ61495 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Dsg1aQ61495 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms