Protein–RNA interactions for Protein: Q61474

Msi1, RNA-binding protein Musashi homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi1Q61474 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Msi1Q61474 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Msi1Q61474 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms