Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

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Length 883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcanQ61361 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcanQ61361 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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BcanQ61361 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
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BcanQ61361 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BcanQ61361 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
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BcanQ61361 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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BcanQ61361 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
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BcanQ61361 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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BcanQ61361 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcanQ61361 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
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BcanQ61361 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BcanQ61361 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
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