Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnna2Q61301 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnna2Q61301 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ctnna2Q61301 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ctnna2Q61301 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms