Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Slc9a1Q61165 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms