Protein–RNA interactions for Protein: Q61056

Trpc1, Short transient receptor potential channel 1, mousemouse

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Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc1Q61056 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trpc1Q61056 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trpc1Q61056 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trpc1Q61056 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Trpc1Q61056 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trpc1Q61056 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trpc1Q61056 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trpc1Q61056 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trpc1Q61056 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trpc1Q61056 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Trpc1Q61056 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trpc1Q61056 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trpc1Q61056 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trpc1Q61056 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trpc1Q61056 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trpc1Q61056 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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