Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Grik1Q60934 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Grik1Q60934 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms