Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cdkn2cQ60772 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms