Protein–RNA interactions for Protein: Q60766

Irgm1, Immunity-related GTPase family M protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irgm1Q60766 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Irgm1Q60766 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Irgm1Q60766 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms